تأسس المركز الدراسي لفرع طولكرم عام 1992 في مبنى صغير مستأجر، وفي (2001/5/25)، ونظرًا للزيادة الكبيرة في أعداد الطلاب، انتقل فرع الجامعة إلى مبنى آخر، وبعد خمس سنوات تم ضم مبنى إضافي. ولفرع طولكرم بصمات واضحة في المحافظة، من خلال المشاركة في اللجان التي يتم تشكيلها، كما أنه نظم العديد من المؤتمرات والندوات وورشات العمل على الصعد كافة، السياسية والاجتماعية والأكاديمية، ضمن المسؤولية المجتمعية للجامعة في محافظة طولكرم.